حلق شامل نازوفارنکس، اوروفارنکس و حنجره است. غشاهای مخاطی این سه به صورت پیوسته و متعلق به دستگاه تنفسی فوقانی هستند. سواب نازوفارنکس و سواب اوروفارنکس فقط مسیرهای نمونه گیری متفاوتی دارند. نمونه گیری دهانی اوروفارنکس استسواب، نمونه برداری از بینی نازوفارنکس استسواببا این حال، به دلیل اوروفارنکسسوابمی توان با باز کردن دهان عمل کرد، نسبتا ساده است، بنابراین بیشتر از نظر بالینی استفاده می شود، اما خطر قرار گرفتن در معرض سمپلر بیشتر است.
آزمایش نوکلئیک اسید نوکلئیک پنومونی کروناویروس جدید می‌تواند سواب‌های نازوفارنکس، خلط و سایر ترشحات تنفسی تحتانی، خون، مدفوع و نمونه‌های دیگر را برای آزمایش از بیمار بگیرد. برای اسید نوکلئیک کروناویروس جدید، اگر اسید نوکلئیک نمونه مثبت باشد، عفونت ویروسی را می توان تأیید کرد. عفونت کروناویروس جدید عمدتاً سلول های اپیتلیال برونش و سلول های اپیتلیال آلوئولی را تحت تأثیر قرار می دهد. نمونه های دستگاه تنفسی تحتانی، مانند خلط و عصاره راه هوایی، باید تا حد امکان استفاده شود تا عفونت ویروسی را با دقت بیشتری منعکس کند.